Sir Winston Churchill a déclaré que durant toute la seconde guerre mondiale sa plus grande peur avait été le danger représenté par les sous-marins allemands. Les Alliés vont donc bombarder intensivement la base sous-marine de Saint-Nazaire, puis la ville quand ils s'aperçoivent que la base est quasiment indestructible.
Les bombardiers britanniques effectuent avec 5 appareils leur premier bombardement significatif sur le port de Saint-Nazaire dans la nuit du 10 au 11 mars 1941, alors que les travaux de construction de la base sous-marine commencent à peine. Ils viennent bombarder le port environ une fois par mois pendant cette année, ce qui est insuffisant pour empêcher les Allemands d'inaugurer les trois premières alvéoles de la base le 30 juin 1941.

("Guide souvenir Le Grand Blockhaus - Musée de la Poche de Saint-Nazaire" par Luc Braeuer, Conservateur du Grand Blockhaus)

Les sous-marins sont protégés par un toit en béton armé de 3,5 mètres d'épaisseur, ce qui les met à l'abri des bombes anglaises du moment. Pourtant les Britanniques ont enfin les moyens de venir en force. Ils se sont remis de la bataille d'Angleterre terminée en octobre 1940 et surtout une grande partie des redoutables chasseurs allemands stationnés en Bretagne vient de partir sur le front de l'Est pour renforcer l'attaque allemande contre l'URSS qui a commencé le 22 juin 1941. Mais il est trop tard pour percer le toit de la base. Ce dernier sera constamment renforcé au cours de la guerre pour contrer les progrès techniques alliés en matière de bombardement.

("Guide souvenir Le Grand Blockhaus - Musée de la Poche de Saint-Nazaire" par Luc Braeuer, Conservateur du Grand Blockhaus)

Le centre ville de Saint-Nazaire est touché pour la première fois dans la nuit du 15 au 16 février 1942, la vie devient vite intenable pour les habitants qui comptent déjà 80 morts entre janvier et avril 1942. Le 9 novembre 1942 marque le début des bombardements américains en plein jour, avec des bombardiers lourds B17 et B24 qui larguent leur cargaison à haute altitude selon le principe du "tapis de bombes". Ce seul bombardement cause la mort de 186 personnes dont 134 jeunes apprentis des chantiers. Début 1943 les autorités civiles publient un  plan d'évacuation de la ville. Dans la nuit du 28 février au 1er mars 1943 cette fois-ci ce ne sont plus les Américains mais 409 bombardiers anglais qui viennent pour raser la ville : ils larguent en effet des milliers de petites bombes incendiaires qui créent près de 600 foyers d'incendie. La population civile évacue la ville dans la première quinzaine de mars. Trois autres bombardements incendiaires britanniques vont suivre jusqu'à début avril, avec l'utilisation de bombes à retardement pour gêner les secours. Les pompiers n'ont même plus d'eau… La ville n'est plus qu'un immense champ de ruines, vide d'habitants, au milieu duquel se dresse, intacte, la silhouette massive de la base sous-marine.

("Guide souvenir Le Grand Blockhaus - Musée de la Poche de Saint-Nazaire" par Luc Braeuer, Conservateur du Grand Blockhaus)